某桥梁工程，其基础为钻孔桩。为了保证工程质量，项目经理部组成了以总工程师为组长的质量控制小组。 1、确定了钻孔桩的质量控制点。内容包括：桩位坐标控制、垂直度控制、清孔质量控制等。 2、该桥梁由A公司总承包，其中桩基础施工分包给B公司，建设单位委托了C公司进行监理。 A公司要求B公司在施工前复核了该工程的原始基准点、基准线和测量控制点，在经A公司技术人员审核签认后，指令B公司进行该桥桩基础的施工。该桥1号桥墩桩基础施工完毕后发现整体桩位（桩的中心线）沿桥梁中线偏移，偏移量超过了规范允许的偏差。经检查发现，造成桩位偏差的原因是桩位施工图尺寸与总平面尺寸不一致所致。于是，A公司与监理公司共同商议按以下方案处理，并由A公司指令B公司尽快组织实施。 （1）补桩； （2）承台的结构钢筋适当调整，外形尺寸做部分改动。 B公司在接到A公司的指令后迅速组织了实施，同时向监理工程师提出了索赔意向通知，并在补桩施工完成后第5天提交了索赔报告： （1）要求建设单位赔偿整改期间机械、人员的窝工损失； （2）增加的补桩应予以计量、支付。 理由是A公司是总承包单位，B公司的桩位放线成果已由A公司审核签认，而桩体本身并没有问题。A公司的做法有无不妥之处？为什么？请指出正确的做法。